第一大愿：

　　经文原文：愿我来世得阿耨多罗三藐三菩提时，自身光明炽然，照耀无量无数无边世界，以三十二大丈夫相、八十随形，庄严其身;令一切有情，如我无异。

　　解读：在其来生得无上正等正觉时，使身体充满光明，庄严美好，而且使众生也如同自己一样。

　　第二大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明广大，功德巍巍，身善安住，焰网庄严过于日月;幽冥众生，悉蒙开晓，随意所趣，作诸事业。

　　解读：在其来生觉悟时，身体明净，功德无量，使众生得到开示，能够随心所欲

　　第三大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，以无量无边智慧方便，令诸有情，皆得无尽所受用物，莫令众生有所乏少。

　　解读：在其来生觉悟时，具有佛教无量的智慧和方便，使众生得到无穷无尽的可使用的物品。

　　第四大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中;若行声闻、独觉乘者，皆以大乘而安立之。

　　解读：在其来生觉悟时，使众生中有错误观念的人都得到觉悟;使佛教中持小乘思想的人都改宗大乘。

　　第五大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若有无量无边有情，于我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒。设有毁犯，闻我名已，还得清净，不堕恶趣。

　　解读：在其来生觉悟时，如果众多有情皈依佛教修梵行时，都能守戒。如果犯了戒，一旦听到药师如来之名，就能得到清净，免于堕入恶道。

　　第六大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，其身下劣，诸根不具，丑陋顽愚，盲聋喑哑，挛躄背偻，白癞癫狂，种种病苦。闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些身有残疾，形态丑陋，有诸病苦的人，都能身体健康，形态端庄，消除种种疾苦。

　　第七大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。我之名号一经其耳，众病悉除，身心安乐，家属、资具悉皆丰足，乃至证得无上菩提。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些贫病交迫，穷困潦倒，无家可归者，能够在听了药师如来的名号之后，可以病痛消除，有家有财，身心安乐，获得无上的觉悟。

　　第八大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若有女人，为女百恶之所逼恼，极生厌离，愿舍女身。闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相，乃至证得无上菩提。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些为女人百恶所逼迫烦恼而不想再作女人者，转变成男人，并获得无上觉悟。

　　第九大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，令诸有情，出魔罥网，解脱一切外道缠缚。若堕种种恶见稠林，皆当引摄置于正见，渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些堕入魔鬼之网和外道邪见的众生，都能获得解脱，接受正见，修菩萨行，达到最高的觉悟。

　　第十大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，王法所录，绳缚鞭挞，系闭牢狱，或当刑戮，及余无量灾难陵辱，悲愁煎逼，身心受苦。若闻我名，以我福德威神力故，皆得解脱一切忧苦。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些在世俗社会中犯了王法而身陷牢狱，面临刑罚的人，一听到药师如来的名号时，可以摆脱这些灾难痛苦。

　　第十一大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，饥渴所恼，为求食故，造诸恶业。得闻我名，专念受持，我当先以上妙饮食饱足其身，后以法味毕竟安乐而建立之。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些为饥渴逼迫而造恶业者，听闻药师如来的名号，得以食饮饱餐，并赋予佛教妙法，使其获得安乐。

　　第十二大愿：

　　经文原文：愿我来世得菩提时，若诸有情，贫无衣服，蚊虻寒热，昼夜逼恼。若闻我名，专念受持，如其所好，即得种种上妙衣服，亦得一切宝庄严具、华鬘、涂香、鼓乐、众望。伎，随心所玩，皆令满足。

　　解读：在其来生觉悟时，使那些因贫困无衣而受苦者，闻听药师如来名号，获得各种上好的衣服以及种种装饰物和娱乐物品，满足人的种种愿望。

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