佛源师系湖南桃江莫氏子，父讳芳有，母贾孺人，诞于西元一九二三年癸亥岁二月廿七日，少而聪慧。年十八，投益阳会龙山栖霞寺智晖上人剃落，法名心净，号真空。方七日，椤严咒已诵熟，寺规法则见即能知。次年赴南岳祝圣寺佛教讲习所，亲近空也、明真、灵涛诸公。
一九四六年春，於福严寺依上镇下清律师受具足。时太虚、芝峰诸师创中国佛教会会务人员训练班，师亦由益阳佛教会选派受训。结业后转入镇江焦山佛学院、宁波观宗学社，皆以世局动荡学潮冲击，未久安住。遂结伴三人朝普陀，途逢异僧助给船资，方至潮音洞，各见瑞相，或为紫竹林，或为护法韦驮，唯师赫然亲见白衣大士趺坐於洞。未几，益阳白鹿寺弘畅老人数电催回，临终付法，嘱继任方丈。寺为魏晋古刹，时住僧百余，蔚然湘中一大丛林。师以自谦故，不欲勉为，唯助益阳佛教讲习所教务，开讲《弥陀经》等。
至一九五一年正月，感无知识摄引，道业难成，乃与觉民南行亲近虚老。至云门，任知客。一日，地方军警到寺清查户品，处置失度，师与监院明空均被拘禁，五月，中央得悉云门受困事，遂遣京中要员至，如获平静。六月十九日虚老传戒，任引礼并增受戒品，虚老赐师号佛源；旋与朗耀、法云同受云门宗法，虚老赐师名妙心。
一九五二年，李济深副主席、周恩来总理邀虚老进京，师随侍起居，照料汤药，历京、汉、苏、沪、杭各寺，协助申请筹备佛协，悉心记录法语开示。次年云门遣印开、宽度迎请虚老回山，来果、苇航、赵朴初诸公虑大局故，阻之。而云门诸师以事极艰繁，需胜福德故，均不肯承命领众。
虚老无奈，乃示监院印开依归元寺规，置诸师名字入简中，於韦驮尊前上供祈祷，大众一一拈之，若连出三次者为和上，遂得师名。众俱欢喜，函告北京。五月，虚老即命师南返。六月初三韦驮圣诞，师升座。自是檀信皈依，海众安和，农禅并举，家风重振。
然诸行无常，世事沧桑，实莫能测。一九五八年反右事起，师蒙冤在狱，虚老入寂，亦不得知。时值三年自然灾害，幸优婆夷老志英、刘宽培竟诚护助，得免饿死。至一九六一年始获释，随交由南华寺劳动监管十八年。师时四大羸弱，病痛折磨，以时时作务，风雨无休故，积疾成疴。诸僧有自缢或返俗者，然师为传佛种故，苦历心志，不畏时艰，日诵《地藏经》、《地藏忏》以祈大士哀佑，今犹未辍，至感大士放光摄护。
文革中，众生业力现前，诸造反派押六祖、憨山、丹田真身至韶关游行，欲焚之而未果。然将六祖真身胸背洞穿，大若婉品，脏腑、灵骨掏掷於地，其状实难卒睹。时师欲落泪亦惧人知，乃冒死收其骨，藏於九龙泉后巨树下。后复虑身命无常，遂遣使告香港圣一法师，来此摄照片归，以待将来。唯祖之脏腑毁矣。众生业力不可思议，一至於此。
至一九七九年，师获昭雪，旋赴中国佛学院主讲律学，兼外事接待、文物管理。以六祖真身事告明真、巨赞及赵朴初会长。朴老震惊立致函广东习书记，习公即委要员至曹溪，助师恢复真身。师常言：六祖骨色如金，坚沉亦如金；丹田灵骨色黑而轻，其有金铜之别乎！
一九八二年，国务院公布云门寺为首批全国重点寺观，师率四众往礼偃祖，县府遂请师还山。其时仅余老僧三人，残存殿宇尽为危房，经像法器几无所有。师既归也，日夜筹度，事必躬亲，领众出坡，不辞辛劳，遂感龙天拥护，四众仰归，住僧渐至百余。
一九八六年传戒，建筑已具规模，赵朴老来寺，赞为：“古刹千年几废兴，喜瞻佛日耀云门；殿堂坏后重重建，经像烧余渐渐增。”又云：“十方翘首宗风振，第一功劳在树人。”至今新增建筑计已二万余平方。师以住持农禅家风为已任，寺僧植果树千余，银杏二百，修竹万竿，自种田地十余亩，禅堂坐香每日六支，冬季五七专精参究，复设佛学院摄引后学，道风远播，德泽普被。
一九九零年，师兼任益阳白鹿寺方丈。
一九九一年，兼任南岳祝圣寺方丈，后任中国佛教协常务理事暨谘议委员会副主席。（1990年）曹溪惟因和尚入寂，群龙无首，管理维艰，诸师虑法身慧命无所依托，丛林芳规难以施行，乃集两序大众议决迎师继南华寺方丈席，于一九九一年十一月、一九九二年三月两席报政府请准，四月初八遂升座。
师自言，忆廿余年前祖之真身遇难事，应加意爱护常住，直如临深履薄，岂敢轻心放逸。师见曹溪门外摊肆杂陈，人车喧嚣，了无秩序，乃极力清徒，以墙围其地，外建石牌门楼，内为水泥车坪，左右摊位，统筹划一。复虑殿堂年皆久远，故集重金处处整修，尤以藏经楼、灵照塔、祖师殿工程为巨，又建虚云和尚纪念以彰祖德。以政府关怀，僧众努力故，不四五年，寺貌为之一新。自石牌楼至九龙泉，足不履泥，悉清净地矣，自曹溪门至祖师殿，楼宇皆坚美，堪为长远计矣，师於祖庭，竭其心血，犹感力不从心，常怀愧意，足见其心如虚空也！
赞曰：
京汉苏沪，随学虚公，韦驮推出，祧云门宗；
舍身忘死，护祖灵骨，子孙万代，得礼真容；
曹溪绵绵，法乳淙淙，德业流芳，弘振家风。
