科学研究发现，水分子是由六角、五角、四角等形态的众多分子团紧密连在一起构成的。但只有六角形的水分子，才是自然界中最清洁、最美丽的原始「生命活水」。六角形是由六个水分子组成，其本身结构非常稳定，一般也不会与其它分子粘合，所以它的分子团非常细小、活泼，有很好的溶解力、渗透力、代谢力和扩散力，它能轻易穿透生物体的细胞外膜，将氧气、养分、矿物质等微量元素带进细胞。它同时有易和人体垃圾附着的特性，从而可使生物体内的废物顺利排出体外。而其它形式的水分子，因很容易和周围的物质结合故体积较大，因而不易进入细胞发挥其滋养人体的作用。

科学研究还证实：水在人体中不仅参与所有营养物质的代谢，而且参与遗传物质的重组；水不但是物质代谢的媒体，而且还是信息传递的载体。但如果我们体内的垃圾不能及时排除，如果我们体内的细胞得不到充分的养分，那么就会使人体加速衰老甚至患病。而对一个健康的人体来说，「生命活水」的总量应保持的一半以上，初生婴儿体内的水几乎都是美丽的六角形。但随着年龄的增长，体内的「生命活水」也会逐渐减少，这也就是人体为什么会衰老及患病的一个重要原因。然而在自然界中，由于人为污染和不良信息的干扰等原因，目前只有在地球的两极与人烟稀少的高山峻岭，才能找到具有六角形图案的「生命活水」。而由李复兴教授率先提出的「水退化」理论，在如今已引起联合国卫生组织的高度重视。

那么，我们有什么办法才能得到六角形的「生命活水」呢？首先应该肯定的一点是，目前用物理和化学手段是不好做到的。如用过滤及加化学药品的方法虽可以去掉工业废水的有害成份，但却无法将被污染的水恢复到先天纯水应有的六角形结构。因为被污染过的水，会导致其分子结构从有序状态变为无序状态，尽管进化后污染物不存在了，但由污染带给水的有害信息却任留在水中。科学家举例说只要给水注入如「药师咒」等一类的良性信息，就可很容易地改变水的分子结构。而这种难以理解的神秘方式，在当前已被许多科学家证明确实有效。

美国生物学家赖特曾经说过：「精神是普遍存在的，它不但存在于生物及它们的细胞中，而且也存在于原子、分子和基本粒子中。」早在上世纪的1994年，日本INM研究所的医学博士江本胜通过摄影机观察放大了的水结晶体时发现：当我们给水以感谢、神圣、关爱一类赞扬的美好语言、文字等信息时，水的结晶体是既美丽又规整的六角形状。但当我们给水以咒骂、痛恨、及悲哀的信息时，水就会变成十分散乱、难看的结晶体。

更奇怪的是当科学家不用语言和文字而只用意念给水实验时，水依然能够感觉到给它好坏信息。科学家们又将水的样本拿到寺院和教堂，结果发现经过诵经的水晶体形状最为美丽。科学家们还将一锅米饭煮熟后分别装在两个玻璃瓶中试验，结果过了一段时间后发现：贴有感谢、友好字样的瓶子米饭变成了微黄色，吃起来味道也要比以前好得多。单贴有愤怒、辱骂标签瓶子的米饭不仅颜色完全变黑，而且还发出难闻的恶臭。江本胜博士最后说：经科学证实，人的意念和情感是完全可以改变水分子的结构，并且还可以影响到我们的身体，所以我们用药师咒水可以改变病人病毒细胞为良性细胞。

2006年元月，俄罗斯生物研究所的科学家斯坦尼斯拉夫--泽宁和日本的江本胜博士合作，在对水的这种神奇特性研究后有发现：当他们将世界各地的自来水与各大洲的泉水及荒郊地下水比较观察时发现绝大部分城市自来水的结晶体都显示模糊不清、形态丑陋。而各大洲的泉水及荒郊地下水的结晶体，却都是如宝石首饰那样令人为之神注的六角形结构。另外科学家还发现，不论你用任何一个国家及民族的语言、文字，都可以使水的结晶体产生神奇的变化。科学家们还将个别具有不同形状和重量的雪花晶体形状和重量与融化前竟完全一样。科学家们又让水倾听不同的乐曲，结果水也会以不同的结晶形态表达不同的感受。

持咒祈祷是我们向药师佛祈求加被的一种常见手段，它既可以表达我们对药师佛及菩萨们的一种尊崇，又可向被祈祷者倾诉或祈求信仰者的心愿。大家知道：祈祷首先能够摆脱我们在日常生活中所遇到种种不悦的消极情感，从而可得到精神上的寄托和安慰，但这只是起到作用中的极小部分。而当由祈祷者强烈信念产生的心力去感应药师佛的悲愿力时，还会产生出一种能力十分巨大的神力，从而就可以解除我们的痛苦及治疗许多疾病。这种祈福活动确实是有效的，并且在这里头还包含有许许多多的科学道理。

据2003年4月14日《参考消息》报导：经科学证实，任何宗教形式都能带来某种预想的效果。当我们长时间的向某一佛像和神像祈祷时这种有益的信息与求助者就会发生共振沟通，从而可治疗某些疾病。

大家总是相信科学，现在大家可能会懂点由科学家来证明了药师咒为什么能治病的原理，大家可相信了吧！由此可见持咒治病不是像俗人所说是心理作用，而是真正治疗！但修药师密咒时，注意一定要与药师佛悲愿相应，与药师佛放琉璃光相应。

——节录自忠明法师《药师法门略解》